Il y a 23 ans, la soeur de Fox Mulder a disparu. Mulder est persuadé qu'elle a été enlevée par une "force extra-terrestre". Aujourd'hui, trois hommes sont tués, tous médecins, qui s'avèrent être des clones venus coloniser la Terre. Ils sont victimes d'un meurtrier caméléon qui a pour but de détruire toute la colonie de ces clones. Mulder et sa partenaire, Dana Scully, doivent trouver les autres avant ce tueur. Mais, en cours d'enquête, la soeur de Mulder réapparaît...

Deux épisodes de la saison 2 (1994-1995).

1.- Colony [épisode 16].

2.- End Game [épisode 17].