Un scientifique complètement dérangé vole les cerveaux des apprentis Psychonauts. Afin de percer le mystère et vaincre l'ennemi, Raz va évoluer dans les esprits les plus fous et développer tout un arsenal de pouvoirs paranormaux. Le joueur va plonger dans cette aventure et rejoindre le monde déjanté des Psychonauts.