L'utilisateur incarne un membre d'une équipe d'élite de six super soldats qui luttent au XXIIème siècle pour rétablir l'ordre dans une communauté de terriens corrompue.... Tout recommence cinq ans après le premier opus, l'action passe de Mars à la Terre, où une communauté est toujours sous le joug du dictateur Sopot. En utilisant l'arsenal à sa disposition, le joueur et son équipe de soldats génétiquement modifiés doivent renverser le dictateur. Il faudra pour cela utiliser toutes les armes mise à disposition pour anéantir Sopot et rétablir l'ordre, et bénéficier de l'aide ponctuelle des autres soldats.